小熊尼奥和熊爸爸熊妈妈住在美丽的小镇中。熊爸爸是一个非常有智慧的发明家和科学家，他给尼奥制造了一匹超级机器马——迈克马，尼奥和迈克马成为了好伙伴。一天，尼奥、迈克马、西西、忍者蛙、咕咚博士在尼奥的实验室里不小心启动了时空穿梭的装置，实验室载着他们一起穿越到地球的其他地方。小熊尼奥环球旅行的故事，由此开始。

故事围绕舒克贝塔为了解决鼠族生死危机展开，两兄弟带领伙伴们完成更高难度的挑战。新一季人物关系更为复杂，情感充沛。在这一季也将揭开琪琪身世的秘密，还会有新的小伙伴加入顺利完成英雄成团路，携手一起乘风破浪。

生物学家胡朔为救基因缺陷的儿子，研究用蚂蚁基因改善人类基因，却遭所有人否定，妻子刘幸之也离他而去。黄锦雄因病资助研究，参观实验室时蚁后逃走变异，带领蚁群攻击众人，胡朔和黄锦雄身体也开始蚁化。最终，刘幸